Його застрелили у власному автомобілі на околиці міста Давао. Свідок, який їхав разом з ним і лишився живим, розповів деякі подробиці кривавого злочину.  Двоє бойовиків під’їхали впритул  до автівки на мотоциклі  Honda XRM  червоного кольору без номерного знака. Пролунали три постріли. Рани виявилися смертельними. Лаяо помер невдовзі після того, як його відправили до лікарні.

Для розслідування вбивства створено  спеціальну робочу групу. На місці злочину знайдено три гільзи від пістолета 45-го калібру.

Поліція вважає найімовірнішим мотивом вбивства Алдіона Лаяо політичний, однак не виключає й інші версії.

Філіппіни залишаються одним із найнебезпечніших місць світу для журналістів. За індексом свободи преси від «Репортерів без кордонів» ця країна посідає 140 місце у списку 179 країн. З 1968 року тут загинуло 150 журналістів.